Je všeobecne známe, že informácia uložená v génoch je jednorozmerná a definovaná lineárnou sekvenciou štyroch znakov (A, C, T, G). Naproti tomu, informácia uložená v proteínoch je mnohorozmerná a závislá na faktoroch ako alternatívny splicing, posttranslačné modifikácie a správne zbalenie, ktoré napokon vedie k jednoznačnej trojrozmernej štruktúre definujúcej biológiu každého proteínu. Samotný proteóm organizmu je navyše časovo veľmi premenný a často sa mení priamo pred očami s podivuhodnou dynamikou (napr. proteínové stroje, signalizačné kaskády a pod.). S tým samozrejme súvisí aj skutočnosť, že metodiky a technológie pre výskum proteómu sú neporovnateľne komplikovanejšie ako postupy použité pri sekvenovaní genómu a často preto vyžadujú kombináciu širokého spektra prístupov vrátane najnovších techník robotického spracovania vzoriek a mikroidentifikáciu proteínu hmotnostnou spektrometriou. Predmetom výberového konania je dodávka kompletného zariadenia založeného na fragmentačnom hmotnostnom spektrometri s MALDI ionizáciou a s analyzátormi TOF/TOF (ďalej len MALDI TOF/TOF spektrometer), ktorý bude určený pre analýzu, identifikáciu a kvantifikáciu komplexných zmesí proteínov z rôznych mikroorganizmov, bunkových línií, tkanív, telesných tekutín a rastlinných materiálov a zároveň umožní aj MALDI Imaging tkanivových rezov. Tým oproti súčasným možnostiam doplní analýzy proteínov o alternatívne prístupy a zároveň ponúkne komplementárne analýzy proteínov. Vzhľadom k faktu, že zariadenie má byť používané aj pre MALDI Imaging, zadávateľ požaduje najrýchlejší MALDI-TOF/TOF spektrometer na trhu s laserom so softwarovo nastaviteľnou rýchlosťou v intervale od 1 Hz až do 1 000 Hz a ultrastabilnou 1 kHz elektronikou TOF/TOF detektora so 4 GHz digitizérom zaisťujúcim plné 1 až 1 000 Hz meranie ako v MS tak aj v MS/MS móde bez straty rozlíšenia. Zariadenie bude s najlepším rozlíšením a presnosťou v MS, ktoré by rutinne malo dosahovať v reflektróne viac ako 40 000 FWHM pre peptidy s m/z okolo 3 000 a presnosť v MS reflektrónovom móde ≤ 2 ppm s internou a ≤ 5 ppm s externou kalibráciou. Súčasťou zariadenia bude aj separačná jednotka na báze multirozmernej chromatografie a server, ktorý umožní nielen komplexné vyhodnocovanie a správu proteomických dát (charakterizácie, lokalizácie PTMs, kvantifikácie labeled in label-free, Top-Down proteomika) ako z MALDI-TOF/TOF merania, tak aj z LC-MALDI experimentov, ale aj kompletný prístup pre vyhodnocovanie z viacerých lokálnych PC staníc cez jednoduchý web interface, čo napomôže pri sieťovaní pracovísk a širokému využitiu zariadenia.
| CPV-Code: |
38434500
|
| Abgabefrist: |
|
| Typ: |
Contract award |
| Status: |
Not applicable |
| Aufgabe: |
Other |
| Vergabestelle: |
| name: |
Virologický ústav SAV |
| address: |
Dúbravská cesta 9 |
| postal_code: |
845 05 |
| city: |
Bratislava - SK |
| country: |
SK |
| email: |
None |
| phone: |
+421 259302405 |
| contact_point: |
Virologický ústav SAV, Dúbravská cesta 9, 845 05 Bratislava |
| idate: |
14. Juni 2020 01:39 |
| udate: |
14. Juni 2020 01:39 |
| doc: |
120642_2011.xml |
| authority_types: |
BODY_PUBLIC |
| activities: |
|
|
| Quelle: |
http://ted.europa.eu/udl?uri=TED:NOTICE:120642-2011:TEXT:SK:HTML |
| Unterlagen: |
None |
| Zuschlagskriterium: |
Lowest price |
| Vertrag: |
Supply contract |
| Prozedur: |
Negotiated without a call for competition |
| Nuts: |
SK010 |
| Veröffentlichung: |
15.04.2011 |
| Erfüllungsort: |
Bratislava - SK |
| Link: |
|
| Lose: |
| Name |
Los Nr 1 MALDI-TOF/TOF spektrometer. |
| Gewinner |
KRD molecular technologies, s.r.o. |
| Datum |
|
| Wert |
758 716,00 € |
| Anzahl Angebote |
1 |
|